1、使用年限不同：

商品房的土地使用年限为70年，自取得该地的土地使用权之时算起。商住两用房的土地使用年限按商用或者综合用地确定，一般使用年限为40、50年。

2、生活成本不同：

商住两用房的水电费用是按照商业用水、用电的标准结算的，要比商品房的收费高出不少，这无疑大大提高了生活成本。

3、社区安全性：

商品房基本上都是在小区内，在安全方面相对比较放心。而商住两用房会经常进行出租、转租等，来往办事的人员多，因此增加了安全隐患，也会对环境卫生的保持带来不小的压力。

商住两用房的缺点

1、生活成本高

商住两用房虽然是商业和住宅的统一体，但物业管理费、水费电费都是按照商业房屋的标准来，比普通住宅的生活成本高出很多。而且部分商住用房出于建筑安全的规定，禁止使用燃气，对于普通生活会带来很多不便。所以从生活成本上来说，要远高于普通住宅。

2、转让契税高

作为具有商业性质的商住两用房，在涉及到费用金钱上的问题时，一般都按商用方式来计算。在商住两用房转让的过程中，税费要比一般商品房高，商住房转让契税为4%，而不超过144平米的普通住宅转让契税仅为2%。不仅如此，商住房转让还要征收营业税、土地增值税等。

3、居住环境问题多

商住两用房面积小，居住密度较大。普通住宅我们常见到一梯两户，两梯四户或者六户，但是在商住两用房的社区，一层可能有6-20户的业主，居住人口的增多，随之带来的嘈杂复杂的生活环境对其他人的生活是肯定会产生影响的。再加上商业属性，有些公司或者是商户运营时间到很晚，难免会打扰其他业主休息。