房屋两证指的是：《中华人民共和国国有土地使用证》和《中华人民共和国房屋所有权证》。

1、房屋所有权证：

《房屋所有权证》是我们国家保护房产的法律凭证，房产所有人必须到产权所在地的房管局申请登记、领取房屋所有权证，依据房产证进行房屋管理、出租、出售、翻修、改建和扩建、房产继承、赠予、交换等等行为。凡涉及房屋产权有关的行为只能以“房屋所有权证”作为确认证件，其它证件是代替不了的。

2、土地所有权证：

从2009年1月份开始，我国颁发的土地所有权证只有两种，一种是集体土地所有权证，另一种是集体土地建设用地使用权证。集体土地所有权证通过县级人民政府来对土地进行登记造册，然后核发证件确认所有权。集体土地建设用地使用权证是指县级人民政府通过对集体所有的依法非农业建设用地进行登记造册，集体土地建设用地使用权证。

房屋的两证分立有什么不好

1、 容易造成有关内容的不一致：

通常情况之下，《房屋所有权证》里面有关土地的内容，是由房管部门通过掌握的历史资料来填写的，但是《土地使用权证》的相关内容则是按照土地管理部门经过实测情况来填写的，所以两者掌握的数据有误差造成输出的结果也是不一样的。

2、 易使违法用地和违章建房合法化：

两证的管理无法高度统一的情况下，房屋两证分立容易给违法、违建的建筑物颁证，比如说给违法占地建房颁发房产证，或者给违章建房颁发土地证。

3、 易造成两证不齐：

在办理了房产证以后，有一段较长的时间不能办理土地证，所以造成很多房主忘却了办理土地证甚至于不办理土地证，影响后续一系列的出售、转让、抵押等等麻烦的事情。

4、容易造成房产重复抵押：

房屋两证分立易造成重复抵押房产，影响房地产金融秩序的有效开展。同时两证的分发，还容易造成国家的土地收益和登记规费的大量流失等等损失。