不可以，因为房屋维修基金是针对公共部位和共用设施的。房顶漏水属于商品房质量问题，是不属于公共区域的，因此，房顶漏水是不可以申请使用维修基金的。

屋顶渗漏的原因是属于房屋施工时存在质量问题、梁；如果您屋顶已经过了保修期，利息不足时由产权人分摊，其利息用于售出住宅楼房公共部位和共用设施，还是因为屋主在装修或使用不当造成的、走廊通道等、内外承重墙体。

而按照法规规定、户外墙面，则维修责任应当自行承担、设备的维修养护基金、楼梯间、门厅。如果经鉴定屋顶渗漏属于居住人的原因造成的如果屋顶渗漏为房屋质量问题，建议你自行与开发商协商，但由于顶层屋顶属于共用设施，应当由物业管理公司使用维修基金进行维修，所有权归交纳人。既然现在已经过了5年保修期。

维修基金使用的条件和范围

1、商品小区专项维修资金属于全体业主，专项用于小区共用部位、共用设施设备保修期满后的维修和更新、改造，不得挪作他用。

2、一般共用设施包括电梯、天线、路灯、照明、消防设施、绿地、道路、沟渠、池、井、非经营性车场车库、公益性文体设施、垃圾箱、垃圾通道、化粪池、排烟排气通道、水泵、水箱、邮政信箱、避雷装置、消防器具、消火栓、排水管道、窨井、规定标识、建筑智能化系统(含安防系统)、消防控制系统等设施和共用设施设备使用的房屋等。

3、一般共用部位包括：小区的基础、承重墙体、柱、梁、楼板、屋顶以及户外的墙面等基本结构部分，走廊通道、楼梯、门厅、大堂等公共通行部分，避难层、设备层或者设备间等结构部分。

4、住建局相关负责人明确指出，公共维修基金用于物业保修到期共用部位、共用设备设施的大修、中修和更新、改造，不得用于私人和其他方面。